AAV 重慶宣尊生物(wù)科(kē)技(jì )有(yǒu)限公(gōng)司
學(xué)習中(zhōng)心

五分(fēn)鍾了解//自噬LC3雙标腺病毒

時間:2024-04-22 熱度:684
Q
什麽是細胞自噬?

A: 自噬是細胞内的一種“自食(Self-eating)”的現象,凋亡是“自殺(Self-killing)”的現象,二者共用(yòng)相同的刺激因素和調節蛋白,但是誘發阈值和門檻不同,如何轉換和協調目前還不清楚. 自噬是指膜(目前來源還有(yǒu)争議,大部分(fēn)表現為(wèi)雙層膜,有(yǒu)時多(duō)層或單層)包裹部分(fēn)胞質(zhì)和細胞内需降解的細胞器、蛋白質(zhì)等形成自噬體(tǐ)(autophagosome),最後與溶酶體(tǐ)融合形成自噬溶酶體(tǐ)(autophagolysosome),降解其所包裹的内容物(wù),以實現細胞穩态和細胞器的更新(xīn)。




細胞自噬分(fēn)類


目前根據發生過程分(fēn)為(wèi)三類:Macroautophagy,Microautophagy和Chaperone-mediated autophagy CMA)。


01

大自噬(Macroautophagy)

細胞的整個區(qū)域被包圍在雙膜小(xiǎo)泡的自噬體(tǐ)中(zhōng),這些自噬體(tǐ)然後與溶酶體(tǐ)融合成為(wèi)自噬溶酶體(tǐ),其内容物(wù)随後被其中(zhōng)的蛋白酶降解。即我們說的自噬(autophagy)

02

微自噬(Microautophagy)

是指溶酶體(tǐ)主動、直接吞噬胞漿成分(fēn)的一種方式。

03

分(fēn)子伴侶介導的自噬(Chaperone-mediated autophagy,CMA)

一些分(fēn)子伴侶,如hsp70,能(néng)幫助未折疊蛋白轉位入溶酶體(tǐ)。通常說的自噬泛指Macroautophagy。



自噬的步驟

步驟1細胞接受自噬誘導信号後,在胞漿的某處形成一個小(xiǎo)的類似“脂質(zhì)體(tǐ)”樣的膜結構,然後不斷擴張,但它并不呈球形,而是扁平的,就像一個由2層脂雙層組成的碗,可(kě)在電(diàn)鏡下觀察到,被稱為(wèi)Phagophore,是自噬發生的鐵證之一。

步驟2:Phagophore不斷延伸,将胞漿中(zhōng)的任何成分(fēn),包括細胞器,全部攬入“碗”中(zhōng),然後“收口”,成為(wèi)密閉的球狀的autophagosome,我把它翻譯為(wèi)“自噬體(tǐ)”。電(diàn)鏡下觀察到自噬體(tǐ)是自噬發生的鐵證之二。有(yǒu)2個特征:一是雙層膜,二是内含胞漿成分(fēn),如線(xiàn)粒體(tǐ)、内質(zhì)網碎片等。

步驟3:自噬體(tǐ)形成後,可(kě)與細胞内吞的吞噬泡、吞飲泡和内體(tǐ)融合(這種情況不是必然要發生的)。

步驟4:自噬體(tǐ)與溶酶體(tǐ)融合形成autolysosome,期間自噬體(tǐ)的内膜被溶酶體(tǐ)酶降解,2者的内容物(wù)合為(wèi)一體(tǐ),自噬體(tǐ)中(zhōng)的“貨物(wù)”也被降解,産(chǎn)物(wù)(氨基酸、脂肪酸等)被輸送到胞漿中(zhōng),供細胞重新(xīn)利用(yòng),而殘渣或被排出細胞外或滞留在胞漿中(zhōng)。


自噬的研究方法

宣尊生物(wù)已開發并完善了多(duō)套自噬相關的研究體(tǐ)系和工(gōng)具(jù),并積累了豐富的自噬研究經驗。
 

正常培養的細胞自噬活性很(hěn)低,不适于觀察,因此,必須對自噬進行人工(gōng)幹預和調節,常用(yòng)的工(gōng)具(jù)藥有(yǒu):


(一)自噬誘導劑
1)Bredeldin A / Thapsigargin / Tunicamycin :模拟内質(zhì)網應激
2)Carbamazepine/ L-690,330/ Lithium Chloride(氯化锂):IMPase 抑制劑(即Inositol monophosphatase,肌醇單磷酸酶)
3)Earle's平衡鹽溶液:制造饑餓
4)N-Acetyl-D-sphingosine(C2-ceramide):Class I PI3K Pathway抑制劑
5)Rapamycin:mTOR抑制劑(這是最常用(yòng)的)

6)Xestospongin B/C:IP3R阻滞劑


(二)自噬抑制劑
1)3-Methyladenine(3-MA):(Class III PI3K)hVps34 抑制劑
2)Bafilomycin A1:質(zhì)子泵抑制劑

3)Hydroxychloroquine(羟氯喹)


除了選用(yòng)上述工(gōng)具(jù)藥外,一般還需結合遺傳學(xué)技(jì )術對自噬相關基因進行幹預:包括反義RNA幹擾技(jì )術(Knockdown)、突變株篩選、外源基因導入等。


細胞經誘導或抑制後,需對自噬過程進行觀察和檢測,常用(yòng)的策略和技(jì )術有(yǒu):
1)觀察自噬體(tǐ)的形成

由于自噬體(tǐ)屬于亞細胞結構,普通光鏡下看不到,因此,直接觀察自噬體(tǐ)需在透射電(diàn)鏡下。Phagophore的特征為(wèi):新(xīn)月狀或杯狀,雙層或多(duō)層膜,有(yǒu)包繞胞漿成分(fēn)的趨勢。自噬體(tǐ)(AV1)的特征為(wèi):雙層或多(duō)層膜的液泡狀結構,内含胞漿成分(fēn),如線(xiàn)粒體(tǐ)、内質(zhì)網、核糖體(tǐ)等。自噬溶酶體(tǐ)(AV2)的特征為(wèi):單層膜,胞漿成分(fēn)已降解。(autophagic vacuole,AV)


2)在熒光顯微鏡下采用(yòng)GFP-LC3等融合蛋白來示蹤自噬形成:(常用(yòng))
GFP-LC3單熒光指示體(tǐ)系:由于電(diàn)鏡耗時長(cháng),不利于監測(Monitoring)自噬形成。我們利用(yòng)LC3在自噬形成過程中(zhōng)發生聚集的現象開發出了GFP-LC3指示技(jì )術:無自噬時,GFP-LC3融合蛋白彌散在胞漿中(zhōng);自噬形成時,GFP-LC3融合蛋白轉位至自噬體(tǐ)膜,在熒光顯微鏡下形成多(duō)個明亮的綠色熒光斑點,一個斑點相當于一個自噬體(tǐ),可(kě)以通過計數來評價自噬活性的高低。宣尊生物(wù)已開發出高效的評價用(yòng)GFP-LC3病毒載體(tǐ),通過瞬時高效感染細胞,配合活細胞工(gōng)作(zuò)站成功評價自噬流。
 
mRFP-GFP-LC3雙熒光指示體(tǐ)系:mRFP用(yòng)于标記及追蹤LC3,GFP的減弱可(kě)指示溶酶體(tǐ)與自噬小(xiǎo)體(tǐ)的融合形成自噬溶酶體(tǐ),即由于GFP熒光蛋白對酸性敏感,當自噬體(tǐ)與溶酶體(tǐ)融合後GFP熒光發生淬滅,此時隻能(néng)檢測到紅色熒光。
 
我們在顯微鏡成像後紅綠熒光merge後通過merge後出現的黃色斑點即隻是自噬體(tǐ).紅色的斑點指示自噬溶酶體(tǐ),通過不同顔色斑點的計數可(kě)以清晰的看出自噬流的強弱.
 
如下圖:細胞轉染mRFP-GFP-LC3病毒後給予氨基酸剝奪處理(lǐ)2小(xiǎo)時後出現明顯增強的自噬以及自噬流.
 
 
3)利用(yòng)Western Blot檢測LC3-II/I比值的變化以評價自噬形成:
自噬形成時,胞漿型LC3(即LC3-I)會酶解掉一小(xiǎo)段多(duō)肽,轉變為(wèi)(自噬體(tǐ))膜型(即LC3-II),因此,LC3-II/I比值的大小(xiǎo)可(kě)估計自噬水平的高低。
(Note:LC3抗體(tǐ)對LC3-II有(yǒu)更高的親和力,會造成假陽性。方法2和3需結合使用(yòng),同時需考慮溶酶體(tǐ)活性的影響。)
 

4) 利用(yòng)Western Blot檢測p62蛋白來評價自噬以及自噬流的強弱:

起初自噬所降解的底物(wù)被認為(wèi)是随機的,但是後來的研究表明有(yǒu)些蛋白是seletively降解的,在這些蛋白之中(zhōng)研究的最為(wèi)透徹的是蛋白p62,p62 is selectively incorporated into autophagosomes through direct binding to LC3 and is efficiently degraded by autophagy ; thus, the total cellular expression levels of p62 inversely correlate with autophagic activity. (一般情況下p62蛋白水平的多(duō)少與自噬流的強弱有(yǒu)着反比例關系)



END

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