基因過表達
基因表達(gene expression)是指将來自基因的遺傳信息合成功能(néng)性基因産(chǎn)物(wù)的過程。基因表達産(chǎn)物(wù)通常是蛋白質(zhì),但是非蛋白質(zhì)編碼基因如轉移RNA(tRNA)或小(xiǎo)核RNA(snRNA)基因的表達産(chǎn)物(wù)是功能(néng)性RNA。
基因過表達(gene overexpression)是将目的基因編碼區(qū)序列(CDS)克隆到相應的質(zhì)粒或病毒載體(tǐ)上,利用(yòng)載體(tǐ)骨架上構建的調控元件,使基因可(kě)以在人為(wèi)控制的條件下實現大量轉錄和翻譯,從而實現目的基因的過表達。此外,還可(kě)選擇報告基因進行示蹤或抗性基因進行篩選。
常用(yòng)的病毒載體(tǐ)有(yǒu)腺相關病毒載體(tǐ)、慢病毒載體(tǐ)、腺病毒載體(tǐ)和逆轉錄病毒載體(tǐ)等,廣泛應用(yòng)于體(tǐ)外和體(tǐ)内基因功能(néng)研究。
常用(yòng)4種病毒載體(tǐ)比較
根據實驗需求、目的基因和用(yòng)途不同,選擇不同的載體(tǐ)。
調控元件選擇
過表達三類載體(tǐ)的特點以及适應性
1. 常規蛋白表達
常規的蛋白表達的同時可(kě)以為(wèi)蛋白表達添加融合或非融合的熒光标簽,親和标簽,亞細胞定位系列等一系列修飾。
載體(tǐ)圖譜結構舉例:
2. 非編碼RNA表達
與常規蛋白表達不同的是,由于非編碼RNA(鏈接非編碼RNA介紹)僅僅轉錄但不翻譯,無蛋白産(chǎn)生,因此此類表達載體(tǐ)(尤其是lncRNA)最好獨立表達熒光蛋白,且常規蛋白表達的修飾基本不能(néng)使用(yòng)。目前常見的非編碼RNA主要為(wèi)microRNA、lncRNA、circRNA三大類表達載體(tǐ)與之對應。
載體(tǐ)圖譜結構舉例:
3. 毒性蛋白表達
細胞毒性蛋白表達與常規蛋白表達的載體(tǐ)除少量修飾外并無在明顯區(qū)别,但在AAV載體(tǐ)制備過程中(zhōng)對表達的毒蛋白進行抑制才能(néng)産(chǎn)生。此載體(tǐ)主要用(yòng)于過表達各種對細胞有(yǒu)毒害的蛋白。
現有(yǒu)載體(tǐ)列表(部分(fēn))
服務(wù)流程
案例展示
1. MEN1(multiple endocrine neoplasia type 1)蛋白能(néng)夠結合P35(Cdk5 regulatory subunit 1)啓動子并促進P35表達。張傑課題組通過對MEN1缺陷小(xiǎo)鼠注射AAV病毒(AAV2-CamKII-p35-T2A-GFP-WPRE)恢複p35的表達,發現增加了神經元樹突的複雜性。如圖1。
載體(tǐ)結構分(fēn)析:CamKII啓動子+ p35基因+自剪切2A肽+非融合GFP綠色熒光标簽。
圖1. 對MEN1缺陷小(xiǎo)鼠注射AAV2-過表達p35病毒可(kě)恢複p35的表達(圖源:Zhuang, K.,et al., Cell reports, 2018)