AAV 重慶宣尊生物(wù)科(kē)技(jì )有(yǒu)限公(gōng)司
學(xué)習中(zhōng)心

一篇被引用(yòng)千次的論文(wén),了解AAV血清型1-9

時間:2023-09-21 熱度:522
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  對于不少“科(kē)研”小(xiǎo)白而言,捋清不同血清型的趨向性和表達量可(kě)以說是非常之有(yǒu)必要,今天小(xiǎo)編就通過一篇發表于Molecular Therapy,影響因子8.986,被引用(yòng)1000多(duō)次的論文(wén),帶大家梳理(lǐ)一下AAV的血清型。論文(wén)題目“Analysis of AAV Serotypes 1–9 Mediated Gene Expression and Tropism in Mice After Systemic Injection”想深入學(xué)習的同學(xué),可(kě)以自己解讀一遍,後面待機閱讀原文(wén)即可(kě)跳轉文(wén)章。


01
AAV基礎知識


首先,解讀這篇文(wén)章之前,先給沒有(yǒu)基礎的同學(xué)介紹一下AAV。


AAV屬于微病毒科(kē),是一種長(cháng)度為(wèi)26 nm、長(cháng)度為(wèi)4.7 kb的線(xiàn)形 DNA病毒。AAV通常與腺病毒同時存在,是在腺病毒制劑中(zhōng)首次發現的一種污染物(wù)質(zhì)。


AAV單股 DNA含有(yǒu) ITR, Cap, Rep 3個組分(fēn).ITR為(wèi)發卡型結構,為(wèi) AAV拷貝與封裝(zhuāng)所需要的惟一順式元件;Cap為(wèi)病毒的核漿蛋白編碼,使得病毒具(jù)備了侵染的能(néng)力;而 Rep,則是負責病毒基因的複制與整合。



基于野生型AAV構建的重組腺相關病毒(rAAv),理(lǐ)論上可(kě)攜帶小(xiǎo)于5kb分(fēn)人基因(通常小(xiǎo)于2.8kb)。


AAV病毒是一種新(xīn)型的病毒,其病毒具(jù)有(yǒu)多(duō)種類型,而不同類型的病毒對不同組織/器官具(jù)有(yǒu)不同的轉染效率(組織嗜性),其表達量及持續時間也各不相同,所以有(yǒu)必要來了解不同類型的病毒之間的差異。



一分(fēn)鍾讀懂論文(wén)


01
表達速度

表達最快:AAV1、6、7、8和9

表達中(zhōng)等:AAV4和5

表達最慢:AAV2和3

02
表達水平

低表達:AAV2、3、4和5

中(zhōng)表達:AAV1、6和8

高表達:AAV7和9

03
不同血清型組織嗜型(表達量由高到低)

AAV9最光譜,在所有(yǒu)組織中(zhōng)均表達,且表達水平很(hěn)高

AAV7多(duō)種組織表達,但在大腦、睾丸、腎髒中(zhōng)無表達

AAV1主要在肝髒中(zhōng)表達,其次是心髒和後肢骨骼肌

AAV6主要在心髒中(zhōng)表達,其次是肺

AAV8主要在心髒中(zhōng)表達,其次是排腸肌、腘繩肌和肝髒

AAV2主要在肝髒中(zhōng)表達,其次是心髒和腘繩肌

AAV4主要在心髒中(zhōng)表達,其次是肺

AAV5僅在肝組織中(zhōng)表達

AAV3的表達水平更低,主要在心髒和肝髒中(zhōng)表達

04
AAV9表達持久性最高,其次為(wèi)AAV6-8,AAV1和4持久性最低
05
所測試的AAV血清型對心髒功能(néng)均無任何影響


文(wén)章解讀

01
實驗設計


  在AAV1-9的包裝(zhuāng)載體(tǐ)上添加熒光素酶基因cDNA,構建不同血清型的AAV,尾靜脈(TV)注射後,在注射後的7、14、29、56和100天(days post-iniection,dpi)對注射不同的血清型動物(wù)進行成像,通過luc的表達量測定不同血清型AAV的表達。


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02
不同血清型表達開始的時間


  AAV1、6、7、8、9的表達量最快,luc的表達量在7dpi即可(kě)檢出;AAV4、AAV5的表達率适中(zhōng),其表達在14dpi,AAV2、3的表達最為(wèi)緩慢,隻有(yǒu)在29dpi時,Luc的表達才能(néng)檢測出來。


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03
不同血清型的表達水平


AAV2、3、4、5為(wèi)低表達組(Low-expressuon Group),表達範圍5,000-200,000 photons/second/cm²;

AAV1、6、8為(wèi)中(zhōng)表達組(Medium-expression Group),表達範圍為(wèi)15,000-200,000 photons/second/cm²

AAV7、9為(wèi)表達組(Hight-expression Group)High-expression Group,表達範圍為(wèi)10,000-1,000,000 photos/second/cm²


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04
不同血清型的組織嗜性(表達量又(yòu)高至低)


AAV9最光譜,在所有(yǒu)組織中(zhōng)均表達,且表達水平很(hěn)高;

AAV7多(duō)種組織中(zhōng)表達,但在大腦、睾丸、腎髒中(zhōng)無表達;

AAV1主要在肝髒中(zhōng)表達,其次是心髒和後肢骨骼肌;

AAV6主要在心髒中(zhōng)表達,其次是肺;

AAV8主要在心髒中(zhōng)表達,其次是排腸肌、腘繩肌和肝髒

AAV2主要在肝髒中(zhōng)表達,其次是心髒和腘繩肌

AAV4主要在心髒中(zhōng)表達,其次是肺

AAV5僅在肝組織中(zhōng)表達

AAV3的表達水平更低,主要在心髒和肝髒中(zhōng)表達


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05
不同血清型表達開始的時間


  本項目以AAV1型,6-9型小(xiǎo)鼠為(wèi)研究對象,采用(yòng)免疫組化技(jì )術,分(fēn)析其在AAV1型和6-9型的小(xiǎo)鼠體(tǐ)内的存留量,确定其在AAV1型和6-9型小(xiǎo)鼠體(tǐ)内的存流量。發現AAV1、AAV4的濃度在1-6h後降低較快,AAV6-8濃度降低較快,AAV9濃度降低較慢。48h後,每個血清中(zhōng)的初始表達量不到1%。


  對100dpi後,不同血清型的組織樣本進行了DNA測序,結果顯示,不同血清型組織樣本中(zhōng),HBV的DNA序列有(yǒu)明顯的變化。


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0

6
不同血清型的心髒功能(néng)的影響


  在進行了100天的尾靜脈注射後,以超音波心動圖來評估其對心功能(néng)的作(zuò)用(yòng),并發現所有(yǒu)被測的AAV血清型對心功能(néng)沒有(yǒu)影響。


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  總體(tǐ)來說,這篇文(wén)獻對AAV1-9血清型進行了比較全面的試驗研究,對于剛接觸AAV的同學(xué)來說,看懂這篇論文(wén)會對不同的AAV血清型有(yǒu)個初步的了解,如果要進一步深入學(xué)習,當然要看更多(duō)的文(wén)獻。


  看完了這篇被引用(yòng)1000多(duō)次的論文(wén)還不過瘾的同學(xué),可(kě)以挑戰下這篇2019年2月1日發表與Nature Reviews Drug Discovery,影響因子64.797的文(wén)章“Adeno-associated virus vector as a platform for gene therapy delivery”,看完這篇文(wén)章,“凡爾賽文(wén)學(xué)”你也行。






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